MeDIP甲基化DNA免疫共沉淀(Methylated DNA Immunoprecipitation,MeDIP),是检测分析基因组甲基化的实验技术。其原理是利用5'-甲基胞嘧啶抗体(anti-m5C),特异识别并结合发生甲基化的DNA片段,形成抗体-DNA片段复合物。通过与免疫共沉淀相似的方法,使用琼脂糖微珠或磁珠捕获并富集抗体-DNA片段复合物。其后通过qPCR或高通量测序,对特定目标区域或者全基因组的甲基化进行分析。
技术流程概述: 1、细胞核或者线粒体提取与基因组片段化 提取培养细胞或者组织的细胞核或线粒体后裂解并收集基因组DNA和蛋白质,随后利用超声破碎仪将基因组DNA打断成200-500bp左右的片段; 2、免疫沉淀 使用5'-甲基胞嘧啶抗体(anti-m5C),再以偶联Protein A、Protein G 或Protein A/G的琼脂糖微珠或磁珠捕获抗体-DNA复合物,通过离心或磁力架收集使抗体-DNA复合物与其他非目标组分分离; 3、纯化与回收 通过不同buffer的洗涤、洗脱,纯化收集甲基化DNA片段; 4、富集DNA的检测分析 通过qPCR、杂交芯片、高通量测序等方法分析所富集的DNA片段信息,最终确定富集DNA的序列信息。
结果展示:
客户提供的材料与信息: 1、目标DNA位点信息; 2、细胞样本,细胞量不低于3×10^7个细胞; 3、组织样本不低于1g; 4、或实验方案设计。 上一篇reverse-ChIP
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