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MeRIP技术服务

RNA甲基化免疫共沉淀(Methylated RNA immunoprecipitation,MeRIP)是研究RNA甲基化修饰的实验技术。其实验原理为使用抗甲基化抗体(如anti-m6A)特异识别目标甲基化修饰模式,形成抗体-RNA复合物,通过与免疫共沉淀相似的方法,使用琼脂糖微珠或磁珠捕获并富集具有目标甲基化修饰的RNA片段,纯化后利用qPCR或高通量测序分析所得的RNA序列。


meRIP 2022-03-11.jpg


技术流程概述:

1、细胞裂解与RNA提取

组织先裂解重悬为单细胞悬液;裂解培养细胞或者组织细胞悬液,提取总RNA,并用DNA酶消化内源性DNA,降低干扰。

2、RNA质检与定量

3、RNA片段化

使用超声处理RNA样品,是RNA打断为约平均100nt的片段。

4、免疫沉淀

使用特异性抗体结合目的甲基化位点,再以Protein A、Protein G 或Protein A/G的琼脂糖微珠或磁珠捕获抗体获取目的抗体-RNA复合体,通过离心或磁力架分离纯化目的抗体-RNA复合物。

5、收集与RNA重抽提

利用洗涤液清洗收集的微珠/磁珠抗体-RNA复合物,其后加入蛋白酶K消化,释放RNA;使用提取试剂,重新抽提RNA。

6、分析检测

通过qPCR或高通量测序检测分析获得的RNA。


结果展示:

meRIP sample.jpg


客户提供的材料与信息:

1、目标RNA位点信息

2、细胞样本,细胞量不低于3×10^7个细胞;

3、组织样本不低于1g

4、或实验方案设计



文章分类: RNA修饰研究表观-RNA
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