DNA pulldownDNA pulldown是在体外研究已知DNA区域与蛋白质相互作用的实验技术。实验原理为利用生物素标记的目标DNA双链片段与细胞核或者线粒体的蛋白提取物共孵育,获得能与目的DNA片段结合的蛋白质,随后洗脱不能结合或非特异结合的蛋白质,最后对分离纯化的蛋白进行WB或质谱分析。该技术广泛用于验证DNA与反式作用因子(如转录因子)和组蛋白修饰酶等蛋白质的结合。
技术流程概述: 1、生物素标记的DNA双链片段合成制备 以目标DNA为模板,设计合成与目标DNA序列一致的生物素标记DNA双链片段。 2、细胞和或线粒体提取 提取培养细胞或者组织的细胞核或者线粒体并裂解,离心去除沉淀后收集裂解物。 3、去除DNA 利用DNA酶处理所得裂解物以去除内源性DNA。 4、Pulldown 生物素标记的目标DNA片段与去除内源性DNA的裂解物共孵育,使生物素标记的DNA片段与蛋白质充分结合。 5、捕获与纯化 使用偶联链霉亲和素的琼脂糖微珠或磁珠捕获生物素标记的目标DNA片段获得目标DNA-蛋白质复合物,通过离心或磁力架分离纯化目标DNA-蛋白质复合物。 6、收集与检测 洗脱收集所获得的蛋白质,其后通过WB或质谱进行检测分析。
结果展示:
客户提供的材料与信息: 1、基因片段信息、待验证的结合蛋白信息等; 2、细胞样本,细胞量不低于3×10^7个细胞; 3、组织样本不低于1g。 |