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HeChuang Biotech, Inc

DNA pulldown

DNA pulldown是在体外研究已知DNA区域与蛋白质相互作用的实验技术。实验原理为利用生物素标记的目标DNA双链片段与细胞核或者线粒体的蛋白提取物共孵育,获得能与目的DNA片段结合的蛋白质,随后洗脱不能结合或非特异结合的蛋白质,最后对分离纯化的蛋白进行WB或质谱分析。该技术广泛用于验证DNA与反式作用因子(如转录因子)和组蛋白修饰酶等蛋白质的结合。

DNA pulldown.png

技术流程概述:

1、生物素标记的DNA双链片段合成制备

以目标DNA为模板,设计合成与目标DNA序列一致的生物素标记DNA双链片段。

2、细胞和或线粒体提取

提取培养细胞或者组织的细胞核或者线粒体并裂解,离心去除沉淀后收集裂解物。

3、去除DNA

利用DNA酶处理所得裂解物以去除内源性DNA。

4、Pulldown

生物素标记的目标DNA片段与去除内源性DNA的裂解物共孵育,使生物素标记的DNA片段与蛋白质充分结合。

5、捕获与纯化

使用偶联链霉亲和素的琼脂糖微珠或磁珠捕获生物素标记的目标DNA片段获得目标DNA-蛋白质复合物,通过离心或磁力架分离纯化目标DNA-蛋白质复合物。

6、收集与检测

洗脱收集所获得的蛋白质,其后通过WB或质谱进行检测分析。


结果展示:

DNA pull down Sample.jpg


客户提供的材料与信息:

1、基因片段信息、待验证的结合蛋白信息等;

2、细胞样本,细胞量不低于3×10^7个细胞;

3、组织样本不低于1g。


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