广州落美生物科技有限公司

HeChuang Biotech, Inc

转运RNA（transfer RNA，tRNA）衍生的tsRNA（tRNA-derived small RNA）是一类新型的小非编码RNA（small non-coding RNA, sncRNA）。TsRNA包括tiRNA（tRNA-derived stress inducible RNA）和tRF（tRNA-derived fragment），主要定位于细胞质中。其中，tiRNA是来源于成熟tRNA剪切形成的半分子，包括5’-和3’-tRNA半分子，长度约30-35nt（如图1）。而tRF是来源于成熟tRNA或前体tRNA的小片段，并根据其在tRNA上对应的位置可进一步分为tRF-5，tRF-3， tRF-1和i-tRF等，长度约为15-30nt（如图1）。

现有研究发现tsRNA有以下几种作用机制：

（1）以类似microRNA的方式参与RNA干扰，包括与AGO蛋白形成复合体结合靶基因mRNA 3’ UTR来抑制后者靶基因表达，以及与tRNA核酸内切酶结合后引导tRNA核酸内切酶切割靶基因mRNA来降低靶基因表达；

（2）结合YBX1等RNA结合蛋白调控靶基因mRNA的稳定性；

（3）调控靶基因mRNA翻译。

通过上述作用机制，tsRNA参与免疫紊乱、代谢紊乱、神经性病变和癌症等多种疾病的发生和发展。

图1 tsRNA生成和分类（引用自“Deciphering the tRNA-derived small RNAs: origin, development, and future”）

目前，本司针对tsRNA可提供以下服务：

（1）检索tsRNA在癌症中的表达情况以及预后价值（prognosis value）

利用公开的现有数据检索tsRNA在多种癌症中的表达情况以及预后价值。

（2）分析tsRNA潜在靶基因和功能

利用生物信息学分析tsRNA潜在靶基因以及tsRNA参与的生理过程和分子通路。

（3）合成tsRNA mimic和inhibitor

根据tsRNA序列设计并合成tsRNA mimic和inhibitor。

（4）检测tsRNA的组织和细胞表达和定位

分别利用实时荧光定量PCR （Quantitative Real-time PCR，qPCR）荧光原位杂交（Fluorescence in situ hybridization，FISH）检测tsRNA在组织和细胞中的表达和定位。

（5）检测tsRNA与靶基因mRNA结合

利用miRNA pulldown、反义RNA纯化技术（RNA Antisense Purification，RAP）等技术检测tsRNA与靶基因mRNA的结合，详情请查看我司“技术服务”-“RNA与RNA的相互作用”。

（6）检测tsRNA与RNA结合蛋白结合

利用miRNA pulldown、RNA免疫沉淀（RNA Immunoprecipitation，RIP）等技术检测tsRNA与靶基因mRNA的结合，详情请查看我司“技术服务”-“RNA与蛋白质的相互作用”。

（7）检测tsRNA对靶基因表达的调控作用

利用双荧光素酶报告基因系统检测tsRNA对靶基因表达的调控作用。

（8）检测tsRNA对靶基因mRNA稳定性的影响

利用放线菌D处理法检测tsRNA对靶基因mRNA稳定性的影响，详情请查看我司“技术服务”-“RNA稳定性研究”。

（9）检测tsRNA修饰

利用RNA甲基化免疫共沉淀（Methylated RNA immunoprecipitation，MeRIP）检测tsRNA甲基化以及利用RNA乙酰化免疫共沉淀（Acetylated RNA immunoprecipitation，acRIP）检测tsRNA乙酰化，详情请查看我司“技术服务”-“RNA修饰研究”。